بدأت المؤسسة سنة 1986 كمركز جامعي تابع لجامعة وهران السانية، لتستقبل أولى الدفعات في كلّيتَي العلوم والآداب.
رُقّي المعهد إلى مركز جامعي بموجب المرسوم التنفيذي رقم 98-402، وضمّ ثلاث معاهد: العلوم الدقيقة، العلوم الاقتصادية، والآداب.
تحوّل المركز إلى جامعة كاملة بموجب المرسوم التنفيذي رقم 09-25 المؤرَّخ في 4 جانفي 2009، تحت اسم «جامعة الطاهر مولاي».
أُضيفت كلّية الرياضيات والإعلام الآلي (MIT) وكلّية الحقوق والعلوم السياسية، ليبلغ عدد الكلّيات 7.
أكثر من 12,000 طالب، 24 قسماً، 7 كلّيات، وشبكة شراكات دولية مع جامعات في فرنسا، السويد، تركيا، المغرب، وكندا.
